!
! Alopecia Universalis associated with a mutation in the human
! hairless gene.  Ahmad et al.  Science 1998; 279: 720-724.
!
! Pedigree used for homozygosity mapping, as per Fig. 1 (p 721).
!
!                    0.02         0.01           0.03
!             D8S258------D8S298--------D8S1786--------D8S1739
! Lod(r=0.01)   2.57        6.04           4.83           1.74
! AR p=0.0001
!
! The pedigree was too complex for multipoint mapping
! at that time
!
set loc alopecia aff .     congenital alopecia universalis 
set loc D8S258   mar 40.11 20411474                        
set loc D8S298   mar 43.18 21817783                        
# HR (hairless homolog)    22027877-22043975
set loc D8S1786  mar 44.18 22489342                        
set loc D8S1739  mar 48.29 24991754                        
read ped inline
AU 101   x   x m n x x x x x x x x
AU 102   x   x f n x x x x x x x x
AU 201 101 102 m n x x x x x x x x
AU 202   x   x f n x x x x x x x x
AU 203 101 102 m n x x x x x x x x
AU 204   x   x f n x x x x x x x x
AU 205 101 102 m n x x x x x x x x
AU 206   x   x f n x x x x x x x x
AU 301 201 202 m n x x x x x x x x
AU 302 201 202 m n 1 3 2 3 5 5 3 2
AU 303   x   x f n x x x x x x x x
AU 304 201 202 f n x x x x x x x x
AU 305 201 202 m n x x x x x x x x
AU 306 203 204 m n x x x x x x x x
AU 307 203 204 f n x x x x x x x x
AU 308 205 206 f n x x x x x x x x
AU 309 205 206 m n x x x x x x x x
AU 310 205 206 m n 1 2 2 3 4 5 2 3
AU 311   x   x f n x x x x x x x x
AU 312 205 206 f n x x x x x x x x
AU 401 302 303 m n x x x x x x x x
AU 402 302 303 m n 1 2 3 4 3 5 2 3
AU 403 302 303 f n 2 3 2 3 3 5 2 2
AU 404 302 303 f n 1 2 x x 1 5 2 3
AU 405 302 303 f n 1 2 3 4 3 5 2 3
AU 406 306 308 f n 2 2 2 3 2 5 2 3
AU 407 306 308 f n 2 3 2 4 1 4 2 4
AU 408   x   x m n x x x x x x x x
AU 409 306 308 m n x x x x x x x x
AU 410   x   x f n x x x x x x x x
AU 411 306 308 m n 2 2 3 4 2 5 2 3
AU 412 306 308 m n 2 2 3 4 2 5 2 3
AU 413 306 308 m n x x x x x x x x
AU 414 306 308 m n x x x x x x x x
AU 415 306 308 f n x x x x x x x x
AU 416 306 308 f n x x x x x x x x
AU 417 309 307 m n 1 3 3 4 1 5 2 3
AU 418 309 307 m n 1 3 3 4 1 5 2 3
AU 419 309 307 f n 2 3 2 4 1 4 2 2
AU 420 310 311 f y 1 3 3 3 5 5 3 3
AU 421 310 311 m n 2 3 1 2 4 5 2 3
AU 422 310 311 m y x x x x x x x x
AU 423 310 311 m n x x x x x x x x
AU 424 310 311 m n 2 3 1 2 4 5 2 2
AU 425   x   x m n x x x x x x x x
AU 501 411 404 f y 1 2 3 3 5 5 3 3
AU 502 411 404 m y 1 2 3 3 5 5 3 3
AU 503 411 404 f n 1 2 3 4 1 5 3 3
AU 504 411 404 m n x x x x x x x x
AU 505 411 404 f n 1 2 3 4 1 5 2 3
AU 506 305 406 f n 2 3 2 3 5 5 2 2
AU 507 305 406 f n x x x x x x x x
AU 508 305 406 f y 1 2 3 3 5 5 3 3
AU 509 305 406 m y x x x x x x x x
AU 510 305 406 m n x x x x x x x x
AU 511 305 406 m y 1 2 3 3 5 5 3 3
AU 512 305 406 m n 1 2 2 3 5 5 2 3
AU 513 305 406 f y x x x x x x x x
AU 514 408 407 m n 2 2 2 3 4 5 2 2
AU 515 408 407 f n x x x x x x x x
AU 516 408 407 m n x x x x x x x x
AU 517 409 410 f n x x x x x x x x
AU 518 409 410 f n 3 3 3 4 1 2 1 2
AU 519 409 410 m n x x x x x x x x
AU 520 409 410 f n x x x x x x x x
AU 521 425 416 f n 3 3 3 4 1 2 1 2
AU 522 425 416 f n x x x x x x x x
AU 601 417 506 m n x x x x x x x x
AU 602 417 506 f y 1 2 3 3 5 5 2 3
AU 603 417 506 m n 3 3 2 4 1 5 2 2
AU 604 417 506 m n 1 3 2 3 5 5 2 3
AU 605 417 506 f y x x x x x x x x
AU 606 417 506 m n x x x x x x x x
AU 607 417 506 f y 1 2 3 3 5 5 2 3
AU 608 417 506 f n 2 3 3 4 1 5 2 2
AU 609 511 518 m n 2 3 3 4 1 5 2 3
AU 610 511 518 f n 2 3 3 4 1 5 2 3
AU 611 511 518 m n x x x x x x x x
AU 612 511 518 m n x x x x x x x x
;;;;
run
