!
! Blau family syndrome pedigree from Figure 2 of
!  Tromp G, Kuivaniemi H, Raphael S et al
!  Genetic linkage of familial granulomatous inflammatory arthritis,
!  skin rash, and uveitis to chromosome 16.  
!  Am J Hum Genet 1996; 59: 1097-1107
!
set loc blau aff
set loc D16S298 mar  57.51   (28400356)
set loc SPN     mar  58.80   (29585296)
set loc D16S411 mar  62.226  (48294236)
set loc D16S308 mar  63.284  (49028837)
set loc D16S416 mar  65.042  (50132661)
set loc D16S419 mar  67.694  (51510863)
read pedigree inline
1 101   x   x m y x x x x x x x x x x x x
1 102   x   x f n x x x x x x x x x x x x
1 201 101 102 m n x x x x x x x x x x x x
1 202   x   x f n 5 1 2 7 3 3 6 4 1 3 5 2
1 203   x   x m n x x x x x x x x x x x x
1 204 101 102 f y 2 6 6 2 3 2 3 4 1 1 2 2
1 205 101 102 m y x x x x x x x x x x x x
1 206   x   x f n 3 6 8 8 5 6 6 2 2 2 1 4
1 207 101 102 m y x x x x x x x x x x x x
1 208 101 102 m y x x x x x x x x x x x x
1 209   x   x f n 3 2 1 8 3 5 4 5 1 1 5 5
1 210 101 102 m y 2 6 6 2 3 5 3 6 1 2 2 2
1 211   x   x f n 3 5 6 6 5 3 5 2 1 1 5 3
1 301 201 202 m n 3 5 8 2 2 3 1 6 1 1 5 5
1 302   x   x f n 6 4 1 2 1 3 4 4 2 1 2 5
1 303 201 202 f n 3 1 8 7 2 3 1 6 1 1 5 5
1 304 201 202 m n 3 5 8 2 2 3 4 6 1 1 5 5
1 305 203 204 m n 6 2 8 6 3 3 5 3 1 1 2 2
1 306   x   x f n x x x x x x x x x x x x
1 307 203 204 m n 2 6 2 2 3 2 5 4 1 1 2 2
1 308   x   x f n 5 3 1 6 3 5 6 2 1 1 6 2
1 309 203 204 f y 2 6 2 2 3 2 5 4 1 1 2 2
1 310   x   x m n 3 4 2 6 3 5 4 6 1 1 4 5
1 311 203 204 f n 2 6 2 2 3 2 5 4 1 1 2 2
1 312   x   x m n 1 6 6 7 2 5 5 5 1 1 5 4
1 313   x   x m n 6 3 2 6 3 4 4 6 2 1 2 3
1 314 205 206 f n 4 6 8 8 2 6 4 2 1 2 2 4
1 315 205 206 m n 4 3 8 8 2 5 4 6 1 2 2 1
1 316   x   x f n 3 6 3 6 3 3 4 5 1 1 1 6
1 317   x   x m n 2 6 2 7 5 5 5 6 1 3 5 2
1 318 205 206 f y 2 6 6 8 3 6 3 2 1 2 2 4
1 319 208 209 m n 4 3 8 1 2 3 4 4 2 1 2 5
1 320 208 209 m y 2 3 6 1 3 3 3 4 1 1 2 5
1 321   x   x f n 3 4 1 1 1 4 6 6 1 1 2 3
1 322 208 209 m y 2 3 6 1 3 3 3 4 1 1 2 5
1 323   x   x f n 5 6 6 4 3 5 4 4 1 1 2 5
1 324   x   x m n 3 6 3 6 2 4 5 5 1 2 4 4
1 325 208 209 f y 2 2 6 8 3 5 3 5 1 1 2 5
1 326 208 209 f n 4 2 8 8 2 5 4 5 2 1 2 5
1 327 210 211 m n 6 3 2 6 5 3 6 2 2 1 2 3
1 328 210 211 m n 6 3 2 6 5 5 6 5 2 1 2 5
1 329   x   x m n x x x x x x x x x x x x
1 330 210 211 f y 2 5 6 6 3 3 3 2 1 1 2 3
1 331 210 211 f n 6 3 2 6 5 5 6 5 2 1 2 5
1 401 301 302 m n 3 6 8 1 2 1 1 4 1 2 5 2
1 402 301 302 f n 3 4 8 2 3 1 6 4 1 2 5 2
1 403 305 306 f n 2 5 6 8 3 3 3 4 1 1 2 1
1 404 307 308 m n x x x x x x x x x x x x
1 405 307 308 m n 6 5 2 1 2 3 4 6 1 1 2 6
1 406 307 308 m n 2 3 2 6 x x 5 2 1 1 2 2
1 407 307 308 m n 6 5 2 1 2 3 4 6 1 1 2 6
1 408 307 308 m n 6 5 2 1 2 3 4 6 1 1 2 6
1 409 307 308 f n 6 3 2 6 2 5 4 2 1 1 2 2
1 410 310 311 m n 4 6 6 2 5 2 6 4 1 1 5 2
1 411 312 311 m n 6 6 7 2 5 2 5 4 1 1 4 2
1 412 313 314 m n 6 4 2 8 3 2 4 4 2 1 2 2
1 413 313 314 f n 6 6 2 8 3 6 4 2 2 2 2 4
1 414 313 314 f n 3 4 6 8 4 2 6 4 1 1 3 2
1 415 313 314 f n 3 4 6 8 4 6 6 2 1 2 3 4
1 416 313 314 f n x x x x x x x x x x x x
1 417 315 316 m n 4 6 8 6 2 3 4 5 1 1 2 6
1 418 315 316 m n 4 3 8 3 2 3 4 5 1 1 2 6
1 419 317 318 m n 6 6 7 8 5 6 6 2 3 2 2 4
1 420 317 318 f n 6 6 7 8 5 6 6 2 3 2 2 4
1 421 320 321 f y 2 3 6 1 3 1 3 6 1 1 2 3
1 422 320 321 f n 3 3 1 1 3 1 4 6 1 1 5 2
1 423 320 321 f n 3 4 1 1 3 4 4 6 1 1 5 3
1 424 320 321 m y 2 3 6 1 3 1 3 6 1 1 2 2
1 425 322 323 f y 3 5 1 6 3 3 4 4 1 1 5 2
1 426 322 323 f n 3 5 1 6 3 3 4 4 1 1 5 2
1 427 324 325 m n x x x x x x x x x x x x
1 428 324 325 m y 3 2 3 6 2 3 5 3 1 1 4 2
1 429 324 325 m n 6 2 6 6 4 3 5 3 2 1 4 2
1 430 329 330 f y 3 2 6 6 1 3 5 3 1 1 5 2
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freq
asp blau
assoc blau
tdt blau
sibpair blau
keep blau D16S298
set plevel 2
apm blau ibd


