!
! Laprise et al Immunogenetics 2000; 51: 695-702
! BHR and atopy versus FCER12B E237G genotype
! 
set iter 1000
set data ../pedigrees
set loc hiIgE aff
set loc indoor aff
set loc AHR aff
set loc outdoor aff
set loc proband aff
set loc E237G marker
read pedigree inline
1 101 x   x   m x x x x n x x 
1 102 x   x   f x x x x n x x 
1 103 x   x   f x x x x n x x 
1 104 x   x   m x x x x n x x 
1 201 x   x   m n n n y n 1 2 
1 202 101 102 f n n n n n 2 2 
1 203 101 102 f n n n n n 2 2 
1 204 101 102 f n n n n n 1 2 
1 205 104 103 m y y n n n 1 2 
1 206 104 103 m n n n n n 2 2 
1 207 104 103 f y y n n n 1 2 
1 208 x   x   m n n n n n 2 2 
1 301 201 202 m n n n y n 2 2 
1 302 201 202 m y y y y n 2 2 
1 303 201 202 m y n n y n 2 2 
1 304 205 204 f n y y n n 1 2 
1 305 205 204 m y y y y y 1 1 
1 306 208 207 m n y y n n 1 2 
1 307 208 207 m n y y n n 1 2 
2 101 x   x   m x x x x n x x 
2 102 x   x   f x x x x n x x 
2 201 x   x   m x x x x n x x 
2 202 101 102 f n n n n n 2 2 
2 203 x   x   m n n n n n x x 
2 204 101 102 f n y y n n 1 2 
2 205 x   x   f n n n n n 2 2 
2 206 101 102 m n y n n n 2 2 
2 207 x   x   f n n n n n 2 2 
2 208 101 102 m n n n n n 2 2 
2 209 x   x   m x x x x n x x 
2 210 101 102 f n n n n n 2 2 
2 211 101 102 f y y y y y 1 2 
2 212 x   x   m n n y n n 2 2 
2 301 201 202 m n n n n n 2 2 
2 302 203 204 f n n n n n 2 2 
2 303 203 204 f y y y y n 1 2 
2 304 203 204 f y y n y n 1 2 
2 305 203 204 f n n n n n 2 2 
2 306 206 205 f y n n n n 2 2 
2 307 208 207 m n n n n n 2 2 
2 308 208 207 f n n n n n 2 2 
2 309 208 207 f n n n n n 2 2 
2 310 209 210 m n n n y n 2 2 
2 311 209 210 f n n n y n 2 2 
2 312 212 211 f n n n n n 2 2 
2 313 212 211 m n n n n n 2 2 
2 314 212 211 m n n n n n 2 2 
2 315 212 211 m n y n n n 1 2 
2 316 212 211 m n y n n n 1 2 
3 101 x   x   m y y y y n x x 
3 102 x   x   f x x x x n x x 
3 201 x   x   f n n n n n 2 2 
3 202 101 102 m n n n n n 1 2 
3 203 x   x   m n n n n n 2 2 
3 204 101 102 f y y y y n 2 2 
3 205 x   x   m n n n n n 2 2 
3 206 101 102 f n n n n n 2 2 
3 207 x   x   m n n n n n 2 2 
3 208 101 102 f y y y y y 1 2 
3 209 101 102 f y y y y n 2 2 
3 210 x   x   m n n n n n 2 2 
3 211 101 102 m n n n n n 1 2 
3 212 x   x   f n n n n n 2 2 
3 213 101 102 m n n n n n 2 2 
3 214 x   x   f y y y y n 2 2 
3 301 202 201 f y y n n n 2 2 
3 302 202 201 f y y y y n 1 2 
3 303 202 201 m y y y y n 1 2 
3 304 202 201 m n n n n n 2 2 
3 305 203 204 f n n n n n 2 2 
3 306 203 204 f y y y y n 2 2 
3 307 205 206 f n n n n n 2 2 
3 308 205 206 f n n n n n 2 2 
3 309 205 206 f n n n n n 2 2 
3 310 207 208 f y y y y n 1 2 
3 311 207 208 f y y y y n 1 2 
3 312 210 209 f n n n n n 2 2 
3 313 211 212 m n n n n n 2 2 
3 314 211 212 m y y y y n 1 2 
3 315 211 212 f n n n n n 2 2 
3 316 211 212 f y y y y n 1 2 
3 317 213 214 f n n n n n 2 2 
4 101 x   x   m x x x x n x x 
4 102 x   x   f x x x x n x x 
4 103 x   x   m x x x x n x x 
4 104 x   x   f x x x x n x x 
4 201 101 102 f n n n n n 2 2 
4 202 103 104 m y y n n n 1 2 
4 203 103 104 m n n n n n 1 2 
4 204 101 102 f n n n n n 2 2 
4 301 x   x   f y y y y y 1 2 
4 302 202 201 m n n n n n 2 2 
4 303 x   x   f n n n n n 2 2 
4 304 202 201 m y y y y n 1 2 
4 305 202 201 f n n y n n 1 2 
4 306 x   x   m n n n n n 2 2 
4 307 202 201 f n n n n n 1 2 
4 308 x   x   m y y y y n 2 2 
4 309 x   x   m x x x x n x x 
4 310 203 204 f y y y y n 1 2 
4 311 x   x   m n n n y n 2 2 
4 312 203 204 f n y n n n 1 2 
4 313 203 204 m n n n n n 2 2 
4 314 x   x   f y y y y n 2 2 
4 315 203 204 m n n n y n 2 2 
4 316 x   x   f n n y n n 2 2 
4 401 302 301 m y y y y n 1 2 
4 402 302 301 m n n n n n 2 2 
4 403 302 301 m y y y y n 1 2 
4 404 304 303 f y y n n n 1 2 
4 405 304 303 f n n y n n 1 2 
4 406 306 305 m y y y y n 2 2 
4 407 306 305 f n n n n n 2 2 
4 408 308 307 f n n n n n 2 2 
4 409 309 310 m y y y y n 1 2 
4 410 311 312 f y y y y n 2 2 
4 411 311 312 f y y y y n 2 2 
4 412 311 312 m y y y y n 1 2 
4 413 313 314 f n n y y n 2 2 
4 414 313 314 m n n n y n 2 2 
4 415 315 316 m y y y y n 2 2 
4 416 315 316 m n n y n n 2 2 
4 417 315 316 f n n y n n 2 2 
;;;;
run
set loc tot qua
tot=hiIgE+AHR+indoor+outdoor
set ple 1
des tot
tab tot
his tot
davie indoor proband
tdt hiIgE
tdt indoor
tdt indoor pat
tdt indoor mat
tdt AHR
tdt outdoor
ass hiIgE
ass indoor
ass AHR
ass outdoor
ass tot
he1 tot sim
sib tot sim
qtl tot
var tot
